Die zunehmende Verfügbarkeit komplexer bildgebender Verfahren erfordert skalierbare und reproduzierbare Softwarelösungen, die in der Lage sind, alle in hochauflösenden, multimodalen Bilddaten enthaltenen Informationen zu nutzen. JIPipe ist eine quelloffene, metadatengetriebene Bildanalyseplattform zur visuellen Erstellung von Analysepipelines ohne Programmierkenntnisse. Das System ist für ein breites Anwendungsspektrum konzipiert und wurde bereits erfolgreich in Studien der Molekular- und Zellbiologie, der Medikamentencharakterisierung und der Materialwissenschaften eingesetzt. Diese Bildanalyseplattform kann auch eine vielseitige Lösung für Imaging Core Facilities bieten, indem es die FAIR-Konformität bei der Erstellung von Arbeitsabläufen fördert.
Automated Image Analysis of Liver Tissue Using JIPipe and ImageJ
Automated image analysis using JIPipe and ImageJ effectively identifies and quantifies liver tissue components in confocal images, enabling detailed studies.…
Bacterial Co-infection model
Combination of wet-lab experiments and in silico modelling to explore interactions between Staphylococcus aureus (Sa) and Acinetobacter baumannii (Ab), which…