Die zunehmende Verfügbarkeit komplexer bildgebender Verfahren erfordert skalierbare und reproduzierbare Softwarelösungen, die in der Lage sind, alle in hochauflösenden, multimodalen Bilddaten enthaltenen Informationen zu nutzen. JIPipe ist eine quelloffene, metadatengetriebene Bildanalyseplattform zur visuellen Erstellung von Analysepipelines ohne Programmierkenntnisse. Das System ist für ein breites Anwendungsspektrum konzipiert und wurde bereits erfolgreich in Studien der Molekular- und Zellbiologie, der Medikamentencharakterisierung und der Materialwissenschaften eingesetzt. Diese Bildanalyseplattform kann auch eine vielseitige Lösung für Imaging Core Facilities bieten, indem es die FAIR-Konformität bei der Erstellung von Arbeitsabläufen fördert.
Characterizing the pore structure of cryo-polymers
A comprehensive image analysis process utilizing both classical thresholding and deep learning with Cellpose was developed to identify and measure…
Complement immune evasion of Candida albicans
The pH-regulated antigen 1 (Pra1) is a hierarchical complement inhibitor that is secreted by the fugal pathogen Candida albicans and…