Die zunehmende Verfügbarkeit komplexer bildgebender Verfahren erfordert skalierbare und reproduzierbare Softwarelösungen, die in der Lage sind, alle in hochauflösenden, multimodalen Bilddaten enthaltenen Informationen zu nutzen. JIPipe ist eine quelloffene, metadatengetriebene Bildanalyseplattform zur visuellen Erstellung von Analysepipelines ohne Programmierkenntnisse. Das System ist für ein breites Anwendungsspektrum konzipiert und wurde bereits erfolgreich in Studien der Molekular- und Zellbiologie, der Medikamentencharakterisierung und der Materialwissenschaften eingesetzt. Diese Bildanalyseplattform kann auch eine vielseitige Lösung für Imaging Core Facilities bieten, indem es die FAIR-Konformität bei der Erstellung von Arbeitsabläufen fördert.
ACAQ
ACAQ is an ImageJ macro designed for the analysis of phagocytosis assays. ACAQ was gradually developed into a full-blown image…
AMIT
The algorithm for migration and interaction tracking (AMIT) approach enables high-throughput segmentation for label-free cells, which does not rely on…